先进的碳十四测定技术的运用，也助力石峁遗址的研究。北京大学考古文博学院吴小红教授团队通过在石峁遗址皇城台、外城东门址、内城后阳湾、呼家洼等地点采集的包括白灰地面、炭化木材、炭化种子、人骨等上百个测年样品，经过碳十四测年技术，取得了一系列测年数据和研究成果，为石峁遗址的年代学研究提供强力的科学依据。

中国科学院古脊椎动物与古人类研究所的付巧妹研究员团队公布了《古基因组对石峁人群来源和遗传结构的研究》。科研团队通过古DNA技术，对陕北及山西晋南地区的多个遗址所出土人骨材料进行基因测序，揭示出石峁人群主要来自陕北地区自仰韶晚期即生活于此的早期人群，同时指出石峁人群与陶寺人群具有遗传上的密切关系。